Шепард, как и в первой части трилогии, имеет возможность выбрать двоих напарников в свою команду, но само число возможных компаньонов увеличено до 10-ти. Кроме того, в отличие от первой части, Шепарду придется заслужить доверие у своих напарников (аналогичный подход к комплектации команды мы могли видеть в Dragon Age: Origins), чтобы они не ушли из команды или не предали его в самый неподходящий момент. От лояльности компаньонов будет во многом зависеть исход игры.
Кроме обычных способностей соответствующих классу напарника у каждого из них будет своя уникальная способность, для разблокировки которой придется выполнить связанный с напарником квест.
Классы напарников в основном являются модифицированными классами, которые доступны Шепарду.
Кроме того что напарник после выполнения его квеста получает новую уникальную способность, он становится Лояльным по отношению к Шепарду, что повышает его (напарника) шансы выжить в финале игры. Так же Шепард может изучить любой (единовременно только один) из уникальных навыков компаньонов (после выполения квеста на лояльность) и может переучиваться в зависимости от необходимости.

Thane Krios (Тейн Криос) — Вид: Дрелл (Drell). Пол: Мужской. Класс: Ассасин (разновидность Штурмовика). Искуссный убийца, очень религиозный.
Grunt[/b] (Грант) — Вид: Кроган. Пол: Мужской. Класс: Солдат. Искусственно выращенный «идеальный» кроган, пытающийся найти свое место в мире.
[b]Subject Zero (Подопытная Ноль) — Вид: Человек. Пол: Женский. Класс: Адепт. Бежавшая заключенная из космический тюрьмы строгого режима. Так же известна как Jack (Джек).
Mordin Solus (Мордин) — Вид: Саларианец. Пол: Мужской. Класс: ученый (разновидность Инженера). Бывший боец подразделения саларианского спецназа Special Task Group. Принимал участие в разработке новой модификации генофага кроганов.
Tali’Zorah vas Normandy (Тали’Зора вас Нормандия) — Вид: Кварианка. Пол: Женский. Класс: Инженер. Была одним из компаньонов Шепарда в первой части игры.
Samara (Самара) — Вид: Азари. Пол: Женский. Класс: Блюститель/Юстицар (Justicar) (разновидность Адепта) — так называют азари посвятивших себя поддержанию справедливости любыми средствами, вплоть до убийства виновного. Происхождение: планета Тессия (Thessia)
Morinth (Моринт) — Вид: Азари. Пол: Женский. Класс: Ардат-Якши (Ardat-Yakshi) (разновидность Адепта). Дочь Самары, страдающая генетическим дефектом, вызывающим психопатию и смерть половых партнеров из-за неправильного ментального слияния. Можно взять в команду вместо Самары (зависит от принятых решений).
Miranda Lowson (Миранда Лоусон) — Вид: Человек. Пол: Женский. Класс: Офицер Цербера (разновидность Стража). Агент Цербера в команде Шепарда. Имеет генетические изменения (если более точно, то создана искусственно из генов ее отца и генов от других доноров, как идеальный человек). Лично знакома с Призраком (Illusive Man).
Jacob Taylor (Джейкоб Тэйлор) — Вид: Человек. Пол: Мужской. Класс: Оперативник Цербера (разновидность Штурмовика). Бывший солдат Альянса. Работал под началом Миранды Лоусон. Протагонист игры Mass Effect: Galaxy вышедшей на iPhone/iPod touch в 2009 году.
Legion (Легион) — Вид: Гет. Пол: Андроид. Класс: Инженер (возможно, Разведчик). «Истинный» гет, носящий кусок брони Шепарда, был показан в самом первом тизере к игре, а также в ролике «Enemies of Mass Effect 2». Гет, посланный найти Шепарда. Причина неизвестна. Рассказывает о существовании «истинных» гетов и «еретиков» (врагов из первой части)
Garrus Vakarian (Гаррус Вакариан) — Вид: Турианец. Пол: Мужской. Класс: Турианский агент (разновидность Разведчика). Знакомый игрокам по первой части игры, бывший сотрудник СБ Цитадели.;

Кроме основных 10-ти напарников из игры, Разработчики заявили как минимум одного нового, который появится в первом DLC. Для него появится отдельная ячейка.

Zaeed Massani (Заид Массани) — Вид: Человек. Пол: Мужской. Класс: - (разновидность Солдата). Охотник за головами, которого Шепард может взять в команду после установки первого DLC прямо в зоне высадки на Омеге. Так же с ним связана миссия на планете Zorya, после которой Заид становится лоялен Шепарду.
Kasumi (Касуми) - Вид: Человек. Пол: Женский. Класс: Вор (разновидность - ). Появится в игре после выхода соответствующего DLC.

Джефф «Джокер» Моро — пилот «Нормандии». Несмотря на свою врожденную хрупкость (синдром Вролика), является лучшим пилотом Альянса. Озвучен Сетом Грином. Во второй части трилогии Джокер так же будет пилотом Нормандии (уже новой). Получил свое прозвище в летной школе за неумение веселиться.
Доктор Чаквас — главный медицинский офицер «Нормандии». Ранее служила с капитаном Андерсоном и любит работать вдали от цивилизованного космоса. Доктор Чаквас предпочитает работу среди солдат в галактике полной жизнью, более захватывающей, чем работу в какой-нибудь человеческой колонии. После гибели «Нормандии SR1» была назначена на высокую должность в больнице марсианской колонии. Несмотря на престижность профессии, уволилась и присоединилась к Церберу ради возможности быть в космосе и летать на новой «Нормандии».
Келли Чэмберс - административный ассистент «Нормандии» а также главный помощник/заместитель Шепарда в его отсутствии, в основу обязанностей которой входит слежка за поступлениями на личный терминал Шепарда новых важных сообщений, передача важной информации членов экипажа Нормандии а также слежка за состоянием рыбок в аквариуме. В добавок ко всему Келли предоставляет психологический портрет состояния команды Шепарда, анализируя ситуацию в целом и излагая таким образом свою точку зрения о том или ином члене экипажа. На вопрос является ли организация Цербер анти-инопланетной она отвечает категорически и настойчиво ,что НЕТ, не является и она свято верит, что даже не смотря на важность целенаправленности Цербера принести пользу именно человечеству, она не верит что это как-то связано с неприязнью или предвзятостью к другим расам (видам)! Келли является потенциальной романтической заинтересованностью Шепарда и дальнейших серьезных отношений.

Жнецы (в первой части Пожинатели, в оригинале Reapers) — раса механических существ, чье вторжение Шепард предотвратил в первой части трилогии, уничтожив Властелина.
Коллекционеры — раса существ, впервые упоминавшаяся во второй книге Дрю Карпишина «Mass Effect: Ascension» («Вознесение»)). Свое название они получили среди населения известной вселенной за привычку обменивать свои технологии на некоторые интересные им объекты. В том числе известны случаи, когда их интересовали представители некоторых рас живущих во вселенной. Также являются потомками протеан.

Illusive Man (Призрак) — руководитель про-человеческой организации Цербер (Cerberus). После уничтожения Нормандии обеспечивает Шепарда новым кораблём. Координирует действия Шепарда, снабжая информацией. Его цель — сделать человеческую расу доминирующей силой. Озвучен американским актером Мартином Шином.

Навигатор (штурман) Прессли — заместитель Шепарда на борту «Нормандии SR1». Член экипажа из первой части игры. Во второй части присутствует только в начальном видеоролике, где погибает вместе с кораблем.

Нормандия SR1 — экспериментальный фрегат, созданный совместно Альянсом и Турианской иерархией, уничтожен во второй части игры.
Нормандия SR2 — новая модификация «Нормандии», созданная силами про-человеческой организации «Цербер», специально для миссии Командора Шепарда, взамен уничтоженной «SR1». В два раза больше оригинальной «Нормандии», хотя и повторяет её общую форму. Добавлены новые палубы и помещения. Также SR2 оборудована системой искусственного интеллекта (что сильно нервирует Джокера и некоторых членов экипажа). Несмотря на то что «Цербер» вложил в постройку этого современного корабля огромные средства, его можно и нужно улучшать во время своих путешествий по вселенной.

Кадьяк — десантный корабль малого радиуса действия. Предназначен для высадки личного состава в случаях, когда космический корабль не имеет возможности приземлиться. Так же может использоваться в космосе для небольших перелетов. Основное средство передвижения команды Шепарда с корабля до поверхности планет. Солдаты альянса дали челноку прозвище "боевой таракан", за его внешний вид и живучесть.
Hammerhead — новое средство передвижения по поверхности планет. Представляет собой танк на воздушной подушке. Появляется в игре вместе с установкой второго анонсированного DLC.

Арсенал в игре претерпел некоторые изменения. Теперь игроку доступны тяжёлые пистолеты, пистолеты-пулеметы, дробовики, штурмовые винтовки, снайперские винтовки и класс тяжёлого оружия представленный уникальными экземплярами оного. Часть вооружения доступна игроку изначально, часть придется найти во время прохождения миссий. Кроме того, теперь умение пользоваться каким то классом оружия зависит от класса (то чем пользоваться не умеем просто не будет отражено в инвентаре для выбора).




Снайперские винтовки

Тяжёлое оружие

Броня Терминус (Terminus Assault Armor) — Увеличивает скорость бега на 10% (Increases sprint speed by 10%), максимальный боезапас всех видов оружия на 10% (All weapons have +10% reserve ammunition) и общий показатель щитов на 15% (Increase shields by 15%);

Оружие Излучатель Сингулярности M-490 (M-490 Blackstorm Projector) — Мощный генератор гравитационного искажения, наиболее эффективен против больших групп врага.

Броня Коллекционеров (Collector Armor) — Увеличивает скорость регенерации на 10% (Increases regeneration rate by 10%), скорость Штурма (Бега во время боя) на 10% (Increases storm speed by 10%) и общий показатель здоровья на 20% (Increases health by 20%);

Штурмовая винтовка Коллекционеров (Collectors Assault Rifle) — Полностью автоматическая винтовка, являющаяся весьма эффективным оружием против целей, защищенных кинетическими барьерами (щитами);

Броня «Инферно» (Inferno Armor) — Бонус к переговорам 10% (Negotiation bonus increase by 10%), увеличивает силу всех умений на 10% (Increases power damage by 10%), скорость Штурма (Бега во время боя) на 10% (Increases storm speed by 10%)
Снайперская винтовка M-29 «Клык» (M-29 Incisor Sniper Rifle) — Стреляет по три выстрела при одном нажатии на курок, эффективна против бронированных врагов и врагов, защищенных кинетическими барьерами (щитами).
Броня «Кровавого дракона» (Blood Dragon Armor) — Увеличивает силу всех умений на 15% (Increases power damage by 15%) и силу (прочность) щитов на 10% (Increases shield strength by 10%).
Интерфейс Стража (Sentry Interface) — Увеличивает силу (прочность) щитов на 5%. (Increases shield strength by 5%)
Визор Тень (Umbra Visor) — Увеличивает силу всех умений на 5% (Increases power damage by 5%).
Шлем Разведчика (Recon Hood) — Увеличивает урон всех видов оружия на 5% (Increases weapon damage by 5%)
Штурмовая Броня Цербер (Cerberus Assault Armor) - Броня, которую Цербер изготовил специально для Шепарда. Увеличивает общие показатели щитов на 10% (Increases shields by +10%), здоровья на 10% (Increases health by +10%), а также увеличивает максимальный боезапас тяжелого оружия на 10% (Increases heavy weapon ammo capacity by +10%);

Дробовик М-22a «Потрошитель» (M-22a Eviscerator Shotgun) — Дробовик с небольшим разбросом, что позволяет уничтожать цели на длинной дистанции, еще один из немаловажных факторов это то, что он практически одинаково хорош в использовнии против всех известных уровней защиты - кинетических щитов, биотические барьеров и брони.

Заид — Цена мести (Zaeed: The Price of Revenge) — Добавляет квест, по результатам которого можно будет принять в команду нового персонажа — Заида Массани — бывшего военного альянса и бывшего же охотника за головами.
Место крушения «Нормандии» (Normandy Crash Site) — После разведки Цербер установили место крушения первой Нормандии. Шепарду предлагается провести более подробную разведку местности, а также установить памятный знак.